 化学研究所（INSTITUTE FOR CHEMICAL RESEARCH） |
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大正15年10月附置 平成16年4月改組 物質創製化学・材料機能化学・生体機能化学・環境物質化学・複合基盤化学 附属先端ビームナノ科学センター 附属元素科学国際研究センター 附属バイオインフォマティクスセンター |
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| エネルギー理工学研究所（INSTITUTE OF ADVANCED ENERGY） |
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昭和16年11月工学研究所附置 昭和46年4月原子エネルギー研究所に改組 平成8年5月エネルギー理工学研究所に改組 エネルギー生成・エネルギー機能変換・エネルギー利用過程 附属エネルギー複合機構研究センター カーボンネガティブエネルギー研究センター |
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| 生存圏研究所（RESEARCH INSTITUTE FOR SUSTAINABLE HUMANOSPHERE） |
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平成16年4月設置 中核研究部（生存圏診断統御研究系、生存圏開発創成研究系） 生存圏未来開拓研究センター |
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| 防災研究所（DISASTAR PREVENTION RESEARCH INSTITUTE） |
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昭和26年4月附置 平成8年5月改組 平成17年4月改組 令和4年8月改組 令和5年4月改組 総合防災研究（社会防災、附属巨大災害研究センター） 地震・火山研究（地震防災、附属地震災害研究センター、附属火山活動研究センター） 地盤研究（地盤災害、附属斜面未災学研究センター） 大気・水研究（気象・水象災害、附属流域災害研究センター、附属水資源環境研究センター） 寄附研究部門 気象水文リスク情報（日本気象協会） 寄附研究部門 地震リスク評価高度化（阪神コンサルタンツ） 産学共同研究部門 アートイノベーション（凸版印刷） |
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| グローバル生存学リーディング大学院 （LEADING GRADUATE SCHOOL FOR SUSTAINABLE DEVELOPMENT AND SURVIVABLE SOCIETIES） |
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平成24年4月グローバル生存学大学院連携ユニット設置 平成30年4月グローバル生存学リーディング大学院に改組 |
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| 持続可能社会創造ユニット（RESEARCH UNIT FOR SUSTAINABLE SOCIETY） |
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令和2年4月1日設置 | |
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| 工学研究科（宇治）（GRADUATE SCHOOL OF ENGINEERING） |
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原子核工学専攻 放射実験室 航空宇宙工学専攻 風洞実験室 超空気力学実験室 附属量子理工学教育研究センター |
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| 農学研究科（宇治）（GRADUATE SCHOOL OF AGRICULTURE） |
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農学専攻 応用生命科学専攻 食品生物科学専攻 |
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| エネルギー科学研究科（宇治）（GRADUATE SCHOOL OF ENERGY SCIENCE） |
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エネルギー基礎科学専攻 | |
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| 環境安全保健機構（宇治）（AGENCY FOR HEALTH, SAFETY AND ENVIRONMENT） |
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産業厚生部門 健康管理室 宇治分室 低温物質管理部門 |
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| 成長戦略本部（宇治）（OFFICE OF INSTITUTIONAL ADVANCEMENT AND COMMUNICATIONS） |
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宇治地区先端イノベーション拠点施設 | |
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| 学生総合支援機構（宇治）（AGENCY FOR STUDENT SUPPORT AND DISABILITY RESOURCES） |
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学生相談センター宇治相談室・保健室 （就職資料スペース） |
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